Die IPNA verfügt über eine Bibliothek und über mehrere wissenschaftliche Sammlungen, die grösstenteils, und jeweils nach Absprache, für Universitätsangehörige sowie externe Forschende zur Verfügung stehen.
Für die Bestimmung der Pflanzenfunde ist eine umfangreiche Vergleichssammlung moderner Samen und Früchte vorhanden. Sie umfasst einen grossen Teil der mitteleuropäischen Flora und besteht aus ca. 7500 Belegen.