• Interdisziplinäre Fragestellungen zwischen Anthropologie, Archäologie, Natur- und Geisteswissenschaften
• Gesundheit, Krankheitsbelastung, Gesellschaft und Umwelt
• Anthropologie, Sozialgeschichte und Basel in der frühen Industrialisierung
• Identifikation menschlicher Skelette unter Berücksichtigung schriftlicher Quellen
• Rekonstruktion historischen Lebensläufe unter Berücksichtigung natur- und geisteswissenschaftlicher Methoden
• Evaluation und Entwicklung anthropologischer Methode

• Bürgerforschungsprojekt Basel (BBS)
• Basel-Spitalfriedhof: Genealogie und Skelette
• Volkszählung Basel 1850, 1860 und 1870: Daten, Begleitpublikation
• Forschung: Zahnzementanomalien, Krankheiten und Geburtenzahlen etc.
• Biomechanik des Handskeletts in Korrelation zur beruflichen Tätigkeit
• HISB – Historisch-Genealogisches Informationssystem Basel

Museum:

• Theo der Pfeifenraucher
• Sonderausstellung „Mumien – Rätsel der Zeit“
• Die Mumie aus der Barfüsserkirche. Anna Catharina Bischoff (1719-1787)