Die Gesteins- und Baustoffsammlung umfasst mehrere hundert Gesteinshandstücke der wichtigsten Gesteine der Schweiz mit Schwerpunkt auf der Nordwestschweiz (u. a. Kalksteine, Sandsteine, Silex, metamorphe und vulkanische Gesteine etc.) sowie Bau- und Werksteine aus archäologischen Kontexten. Dazu gehören z. B. verschiedene Marmore, geschliffene Kalksteine, oder die wichtigsten Bau- und Werksteine von Basel und Augusta Raurica.
Die Sammlung steht Forschenden und Lernenden auf Anfrage zur Verfügung: